A kutatók csaknem 2000 új bélbaktériumot fedeznek fel
Számos friss tanulmány szerint az emberi bélbaktériumok képesek befolyásolni fizikai és mentális egészségünk különböző aspektusait. Ennek ellenére sok baktérium továbbra sem „feltérképezve” a tudósok által. Egy új tanulmány körülbelül 2000 korábban ismeretlen bélbaktériumot tárt fel.
A legfrissebb tanulmányok, amelyeket a Orvosi hírek ma kimutatták, hogy a bél mikrobiotájának szerepe lehet a Parkinson-kórban és a demenciában, és megmagyarázhatják, miért működik jól a 2-es típusú cukorbetegség gyógyszere egyeseknél, másoknál azonban nem.
Új kutatás - tegnap jelenik meg a folyóiratban Természet - mára csaknem 2000 új bélbaktérium-fajt azonosított, amelyeket a tudósok még soha nem tenyésztettek laboratóriumban.
Az Európai Bioinformatikai Intézet (EMBL-EBI) és a Wellcome Sanger Intézet (az Egyesült Királyság Hinxtonban) kutatócsoportja számítógépes elemzéssel értékelte a résztvevők bélmikrobiómamintáit a világ minden tájáról.
"A számítási módszerek lehetővé teszik, hogy megértsük azokat a baktériumokat, amelyeket még nem tudunk tenyészteni a laboratóriumban" - magyarázza Rob Finn, az EMBL-EMI tanulmány szerzője.
„A metagenomika [a genetikai anyag elemzése] felhasználása a baktériumok genomjainak rekonstrukciójához kissé olyan, mint több száz rejtvény rekonstruálása az összes darab összekeverése után, anélkül, hogy tudnánk, milyen a végső kép, és miután néhány darabot teljesen eltávolítottunk a keverj csak azért, hogy ez kicsit nehezebb legyen - folytatja.
Finn azonban megjegyzi: "A kutatók most abban a szakaszban vannak, hogy számos számítási eszközt használhatnak a laboratóriumi munka kiegészítésére és néha irányítására, hogy új betekintést nyújtsanak az emberi bélbe."
Új megközelítés
A csapat képes volt rekonstruálni 92 143 genomot 11 850 különböző bélmikrobiota mintáiból.
Ez lehetővé tette a kutatók számára, hogy 1952 olyan bélbaktérium-fajt azonosítsanak, amelyekről eddig ők és mások nem ismertek.
Finn és munkatársai elmagyarázzák, hogy sok baktériumfaj „alacsony szinten tartotta magát”, hogy úgy mondjam, mert a tudósok csak nagyon alacsony számban találták őket a bélben, vagy nem tudnak túlélni a bélkörnyezeten kívül.
Ez - megjegyzik - eddig megakadályozta a tudósokat abban, hogy ilyen fajokat vegyenek fel a bélbaktériumok listájára, amelyekről tudnak. Ez az oka annak is, hogy a jelenlegi vizsgálatot végző csapat új útvonal mellett döntött - és számítási módszerek kombinációjával próbálta kidolgozni az emberi mikrobiota átfogóbb „térképét”.
"A számítási módszerek lehetővé teszik számunkra, hogy képet kapjunk az emberi bélben élő sok baktériumfajról, azok fejlődéséről és arról, hogy milyen szerepet játszhatnak mikrobiális közösségükön belül" - mondja Alexandre Almeida, a tanulmány társszerzője.
A „szilárd terv” létrehozása felé
„Ebben a tanulmányban - magyarázza Almeida - a gasztrointesztinális baktériumok legátfogóbb nyilvános adatbázisát használtuk fel a korábban nem látott baktériumfajok azonosítására. Az általunk alkalmazott elemzési módszerek nagyon jól megismételhetőek, és a jövőben nagyobb, változatosabb adatkészletekre is alkalmazhatók, lehetővé téve a további felfedezést. "
A jövőben a kutatók remélik, hogy ez és hasonló tanulmányok tovább segítik az emberi bél megértését, ami viszont hozzájárul a különféle állapotok jobb kezelésének kialakításához.
"Az ilyen kutatások segítenek az emberi bél úgynevezett tervének elkészítésében, amely a jövőben segíthet jobban megérteni az emberi egészséget és betegségeket, és akár a gyomor-bélrendszeri betegségek diagnosztizálásában és kezelésében is segítséget nyújthat."
Tanulmány társszerzője, Trevor Lawley, a Wellcome Sanger Intézet munkatársa
Ugyanakkor a csapat megjegyzi, hogy a jelen tanulmány tudatosította a kutatókat a bélbaktériumok körüli kutatások nagy hiányosságában.
A tudósok jelenleg viszonylag keveset tudnak az Európában és Észak-Amerikában lakóaktól eltérő populációkra jellemző baktériumfajokról - hangsúlyozzák a kutatók.
„Látjuk, hogy sok ugyanaz a baktériumfaj gyűlik össze az európai és észak-amerikai populációk adataiban. Azonban az a néhány dél-amerikai és afrikai adatkészlet, amelyhez hozzáférhettünk ehhez a tanulmányhoz, feltárta a jelentős sokféleséget, amely a korábbi populációkban nem volt jelen "- jegyzi meg Finn.
"Ez azt sugallja, hogy az alulreprezentált populációkból származó adatok gyűjtése elengedhetetlen, ha valóban átfogó képet akarunk elérni az emberi bél összetételéről" - teszi hozzá, és arra ösztönzi a kutatókat, hogy továbbra is változatosabb kohorszokra összpontosítsanak.
