Prosztata rák: A nagy adatok 80 új gyógyszercélpontot nyitnak meg
A prosztatarák genetikájának elemzésére szolgáló legnagyobb tanulmányban a tudósok nem kevesebb, mint 80 új potenciális gyógyszercélot találnak. A projekt széles utakat nyit meg az új kezelések megtervezéséhez.
A genetikai adatok kinyerése valamikor nehézkes és hihetetlenül időigényes feladat volt.
Amint azonban a technológia folyamatosan fejlődik, a munka jelentősen gyorsabbá és olcsóbbá vált.
Ezzel párhuzamosan a nagy adatkészletek kezeléséhez rendelkezésre álló eszközök jelentősen javultak.
Összességében ez azt jelenti, hogy a genetikai kódból gyűjtött információk óceánjai elemezhetők, feltérképezhetők és viszonylag könnyedén kombinálhatók, hogy új szintű tisztaságot nyújtsanak.
A közelmúltban egy nemzetközi csapat a DNS-elemzés és a nagy adatok ezen kettős megközelítését alkalmazta a prosztatarák genetikájának elmélyítéséhez. A betegség páncéljában lévő molekuláris csíkok vadászatakor a kutatást az Egyesült Királyságban, Londonban, a Rákkutató Intézet szervezte.
A prosztatarák kihívásai
A prosztatarák a második leggyakoribb rák a férfiak körében az Egyesült Államokban. Ebben az évben az Egyesült Államokban becslések szerint 164 690 új prosztatarák és majdnem 30 000 haláleset következik be a betegségben.
Bár a kutatók előreléptek a prosztatarák megértésében és kezelésében, még mindig számos nehézség áll fenn.
Ahogy a tanulmány vezetője, Prof. Rosalind Eeles kifejti: "Az egyik kihívás, amellyel szembesülünk a rákkutatásban, a betegség összetettsége és a lehetséges kezelések puszta száma."
Dr. Justine Alford, az Egyesült Királyság Rákkutató Intézetéből egy másik kérdést vázol fel a prosztatarák tanulmányozásában és beavatkozásában.
"A prosztatarák elleni további előrehaladás egyik fő akadálya" - magyarázza - "az a módszer hiánya, hogy pontosan megjósolhassuk az ember betegségének előrehaladását, így kihívást jelent, hogy melyik kezelés a legjobb az egyes betegek számára."
A genetikai adatok betakarítása
A probléma új irányból történő megközelítése érdekében a kutatók 112 prosztatarákban szenvedő férfitól vettek genetikai információt, és számos más vizsgálat adataival kombinálták őket. Összességében 930 beteg mintáját használtuk.
A legújabb big data technikák alkalmazásával a csapat új betekintést nyert a genetikai változásokba, amelyek elősegítik a prosztatarák kialakulását és elősegítik annak előrehaladását. Miután megértették, hogy mely gének érintettek, elkészíthették az e gének által kódolt fehérjék térképét.
Ezután a canSAR nevű adatbázishoz fordultak, amely egyesíti a vizsgálatok adatait, alkalmazza a gépi tanulást, és segít betekintést nyújtani a kábítószer-felfedezésbe.
Weboldalán a canSAR elmagyarázza azokat a kérdéseket, amelyekre adatbázisuk célja megválaszolni: „Mi ismert egy fehérjéről, mely rákokban fejeződik ki vagy mutálódik, és milyen kémiai eszközökkel és sejtvonal-modellekkel kísérletezhetjük aktivitását? Mit lehet tudni egy gyógyszerről, sejtérzékenységi profiljáról, és milyen fehérjék kötődnek, amelyek megmagyarázhatják a szokatlan bioaktivitást? "
A tudósok megállapították, hogy az általuk feltárt fehérjék közül 80 potenciális gyógyszer célpont volt. Ezek közül 11-et már meglévő gyógyszerek céloztak meg, hét másik pedig már a klinikai vizsgálatok során is megcélozható volt.
Eredményeiket a héten teszik közzé a folyóiratban Természetgenetika.
"Vizsgálatunk csúcstechnikákat alkalmazott a nagy adatok elemzésében, hogy rengeteg új információt nyújtson a prosztatarákról és a betegség leküzdésének lehetséges módjairól."
Prof. Rosalind Eeles
A jövőre nézve
A felfedezések további tanulmányozást igényelnek, mielőtt természetesen klinikailag felhasználhatók lennének, de számos új lehetőséget kínálnak.
Mint Paul Workman, a társszerző magyarázza: „Ez a tanulmány figyelemre méltóan sok új gént tárt fel, amelyek a prosztatarák kialakulását ösztönzik, és létfontosságú információkat adott arról, hogyan lehet a betegség biológiáját kiaknázni az új lehetséges kezelések megtalálásához. ”
Reméli, hogy munkájuk „ösztönözni fogja az általuk azonosított genetikai változások és potenciális gyógyszercélok új kutatási hullámát azzal a céllal, hogy a betegek minél előbb részesüljenek előnyökből”.
A prosztatarák kezelésének megtervezésének másik buktatója az, ahogyan a betegség másként halad előre. Ez sokkal megnehezíti annak eldöntését, hogy mely kezelési lehetőségek felelnek meg az egyes betegeknek a legjobban.
Dr. Alford reméli, hogy „[a] nagyban javítja a betegség mögött rejlő genetika megértését, [...] a jövőben ez a tudás segíthet az orvosoknak abban, hogy jobban igazítsák a kezeléseket az egyén rákjához, és remélhetőleg több embert látnak túlélni betegségükön. ”
Ezek korai idők, de a tanulmányok következő generációjából származó eredmények átalakulhatnak a területen.
